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一、繼續加大對財政支出結構的審計

根據建立公共財政基本框架的要求，本級預算執行審計要在對財政收支真實、合法性審計的基礎上，逐步向支出結構的合理性和效益性方面深化。審計中，要分析財政支出格局是否根據建立公共財政基本框架的要求進行了調整，重點是否放在為國家正常運轉提供財力保障、是否加大對那些代表社會共同利益和長遠利益的社會公益性事業的支出、是否在逐步提高財政對社會保障支出的比例，以及加大財政對基礎設施及基礎產業的投資力度等方面。支出的范圍、結構是否符合這些重點，是否按照“保工資、保穩定、保法定支出”的順序合理調度資金，克服財政“越位”和“缺位”的現象，使有限的財力更好地發揮效益。

二、加強對各部門、單位預算編制和執行情況的審計

本級預算執行審計應首先對預算編制的真實性、合理性進行審計，特別是要對一些有資金二次分配權力的部門和使用財政資金數額大、下屬單位多的部門的預算情況進行重點審計，看該列的收入是否如實反映，支出項目是否真實，有無虛列、截留、挪用或層層留機動指標的情況，部門預算編制是否合理、合規，部門之間、項目之間是否苦樂不均。總之通過對部門預算編制和執行的審計，強化預算的約束和預算分配的透明度，促使有限的財力分配更趨合理，從機制和源頭上促進財政資金的有效配置。

三、加強對財政轉移支付資金的審計

公共財政框架下的財政轉移支付制度的建立就是要通過轉移支付方式，支持和促進貧困、落后地區的財政、經濟發展，使下級公共服務能力實現均等化目標。近年來，經濟欠發達縣的上級財政轉移支付資金成為政府財政支出的主要來源之一，且一些特定用途或專項補助的資金數量和支付范圍不斷擴大，涉及農業(大農業)、水利、交通、教育、社保、就業、扶貧、救災等諸多方面，使每年的財政總預算支出結構發生較大的變化，這種特定用途的資金或專項資金比例的提高，使審計的范圍和手段要作相應的調整。突出“全面性”，不但要查上級資金的到位、撥付情況，還要查清地方財政資金的到位情況。一方面，要審查全部資金的到位率和撥付資金的及時性、合法性、合規性，查清不到位資金的原因，以及擠占挪用專項轉移支付資金的違規違紀違法行為，并對此產生的影響作出相應的評價;另一方面，要對本級財政安排的配套資金到位率進行認真核實，確認資金是否真正到位。對發現的大額支出要作進一步的跟蹤，查清是否存在本級預算資金虛假到位或利用其他手段將資金抽回的問題。

四、加大對預算編制各環節的合理、合法性審計

主要審查預算編制、預算批準、預算批復三個環節是否科學、完整、合理。財政部門編制提交人大、并經人大批準的預算，財政部門有沒有按照《預算法》的規定及時批復到各部門，批復的事業單位的經費預算是否完整；確實需要預算調整時，財政部門有沒有相應的調整方案，是否經人大批準。

五、加強對國庫集中收付的審計

建立國庫單一賬戶體系，規范收入收繳和支出撥付程序，實行集中收付，這是財政國庫改革的主要內容，也是國際通行做法。審計監督的重點應與改革同步，監督的目光應轉到“集中收付”上來。首先要審查各級財政、稅務和其他征收機關預算內外收入繳庫方式、程序是否合規，收入是否進入國庫同一賬戶，有無違規進入過渡戶或通過私設賬戶、“小金庫”截留、挪用財政收入等違規、違紀情況；未納入預算管理的行政事業性收費、預算外資金、財政專戶管理及“收支兩條線”管理是否合規等情況。其次要監督國庫集中支付資金的真實性、合法性，看有無不按預算和程序支付或利用集中支付、集中核算之機，為某些部門開方便之門；有無一方面集中支付，另一方面一些資金又分散管理，使“集中支付”、“會計核算中心”有名無實等問題。另外，通過國庫集中支付的審計，改進和完善管理，促使此項制度健康運轉。

六、加強對政府采購的審計

實行政府采購是預算制度改革的一項重要內容，政府采購審計是加強預算管理，提高財政資金使用效益，從源頭上預防和治理腐敗的一項根本措施，也應作為預算執行審計的重點。

七、加強對具有收入監督和下撥資金雙重職能的預算執行單位的延伸審計

這些單位不但資金量大、環節多、管理要求也相對要求較高。針對這種情況，一般僅從相關賬目核對預算下撥或收入上繳情況，難以準確確定其完整性、正確性，必須在核對的基礎上對收入的性質、計算依據的準確性進行確認。一是核對賬目數字。將預算單位審計度年內所反映的收入、支出總額與財政部門的數據核對，并按照預算規定核對查證，對于兩個年度內的欠繳、欠撥情況進行詳細登記，從中發現截留、挪用財政性收入問題和財政性資金游離于財政監督之外的問題，以及隨意安排非預算項目支出的問題。二是對收入性質、計算基數的準確性進行確認。混淆財政性資金的性質，為代收單位自身謀利益是近幾年出現的一種隱蔽性違紀行為。其主要手法是在第一環節改變資金原有的性質或人為調整應計收入的基數。這種違紀行為具有隱蔽、大額、容易造成國庫資金流失和產生腐敗的性質，如果不作進一步檢查核對是很難發現的。