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摘要:目的探討lncRNACCAT1在肝細(xì)胞肝癌中的表達(dá)及其臨床意義。方法采用熒光定量PCR檢測檢測96例肝癌癌灶組織及癌旁組織中l(wèi)ncRNACCAT1的表達(dá)情況,并分析與各臨床病理因素以及患者預(yù)后的相關(guān)性。結(jié)果lncRNACCAT1在肝癌癌灶組織表達(dá)升高;肝癌癌灶組織中l(wèi)ncRNACCAT1表達(dá)量和門靜脈癌栓、TNM分期等因素相關(guān)。進(jìn)一步生存分析發(fā)現(xiàn)lncRNACCAT1表達(dá)陽性者術(shù)后平均生存時間(32.1個月,95%CI:26.3~38.0個月)明顯短于陰性患者(47.2個月,95%CI:42.5~52.0個月),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=7.607,P=0.006)。并且lncRNACCAT1表達(dá)是肝癌患者總體生存的獨立危險因素。結(jié)論lncRNACCAT1表達(dá)在肝癌發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要作用;lncRNACCAT1表達(dá)是肝癌患者的獨立預(yù)后因素。
關(guān)鍵詞:長鏈非編碼RNACCAT1肝細(xì)胞肝癌生存分析
肝癌是世界范圍內(nèi)的高發(fā)惡性腫瘤之一,盡管隨著現(xiàn)代醫(yī)療技術(shù)的進(jìn)步,肝癌的診療手段已漸趨成熟,但是其術(shù)后5年復(fù)發(fā)率仍高達(dá)80%,每年約有超過600000人死于肝癌,缺乏有效的診療、監(jiān)測靶點是造成肝癌患者預(yù)后低下的原因[1]。長鏈非編碼RNA(longnon-codingRNA,lncRNA)是一組長度>200個核苷酸、缺少完整的開放閱讀框和無蛋白質(zhì)編碼功能的RNA。近年來研究顯示,lncRNA具有各種不同的生物學(xué)功能,作為抑癌或致癌基因參與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展。lncRNACCAT1被證實高表達(dá)于結(jié)腸癌、胃癌、膽囊癌,然而在肝細(xì)胞肝癌中的表達(dá)情況仍不清楚[2~4]。本研究中筆者采用熒光定量PCR法檢測肝癌組織中l(wèi)ncRNACCAT1中的表達(dá)情況,并分析其與臨床病理因素的相關(guān)性。
材料與方法
1.標(biāo)本來源:
收集2005年9月~2010年10月在溫州醫(yī)科大學(xué)附屬浙江省臺州醫(yī)院接受手術(shù)治療的96例HCC患者的組織標(biāo)本(包括癌灶組織及相應(yīng)癌旁組織),術(shù)后均確診為肝細(xì)胞肝癌。腫瘤病理診斷參照世界衛(wèi)生組織標(biāo)準(zhǔn)、臨床分期標(biāo)準(zhǔn)參照美國癌癥聯(lián)合委員會(AJCC)制定的第7版TNM分期標(biāo)準(zhǔn)[5]。術(shù)前患者均未接受放化療或其他任何藥物干預(yù)。并有完整臨床病理資料(年齡、性別、病理診斷、門靜脈癌栓、酗酒、腫瘤直徑、TMN分期等)。所有患者中位隨訪時間為38.5個月(2.0~60.0個月),其中57例死于肝癌。為研究lncRNACCAT1的臨床相關(guān)性,筆者根據(jù)CCAT1表達(dá)量將數(shù)據(jù)平均分為兩組,即CCAT1高表達(dá)組和CCAT1低表達(dá)組,并對肝癌組織中l(wèi)ncRNACCAT1的表達(dá)量與各臨床病理因素的關(guān)系進(jìn)行分析。所有人體標(biāo)本的研究均事先獲得倫理委員會的批準(zhǔn)。
2.實時定量聚合酶鏈反應(yīng)(real-timePCR)檢測肝癌及癌旁組織中l(wèi)ncRNACCAT1的表達(dá):
采用Tr-izol試劑盒(美國Invitrogen公司,Carlsbad,CA)試劑盒抽提總RNA。采用ABI公司的HighCapacitycD-NAReverseTranscription試劑盒將RNA反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,反轉(zhuǎn)錄反應(yīng):25℃10min,37℃120min,85℃5min,4℃保存。RT-PCR采用ABI公司PowerSYBRGreenPCRMastermix試劑盒及ABI7900HT系統(tǒng),以GAPDH為內(nèi)參基因,使用2-△△Ct法計算lncRNACCAT1在肝癌組織相對于癌旁組織的表達(dá)量,并根據(jù)其表達(dá)水平中位數(shù)將肝癌患者分為低表達(dá)組和高表達(dá)組,分析CCAT1表達(dá)與臨床病理參數(shù)及預(yù)后的關(guān)系。引物序列如下:CCAT1上游引物:5'-GCCGTGTTAAGCATTGCGAA-3',下游引物:5'-AGAGTAGTGCCTGGCCTAGA-3';GAPDH上游引物:5'-GAAATCCCATCACCACTTCCAGG-3',下游引物:5'-GAGCCCCAGCCTTCTCCATG-3'。
3.統(tǒng)計學(xué)方法:
實驗結(jié)果應(yīng)用SPSS20.0統(tǒng)計學(xué)軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析。不同組間的差異評估采用Student'st-test或χ2檢驗,生存分析用Kaplan-Meier和Log-rank檢驗,多因素分析用COX回歸模型,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
結(jié)果
1.lncRNACCAT1在肝癌癌灶及癌旁組織中的表達(dá):qRT-PCR結(jié)果經(jīng)Student'st-test檢驗提示肝癌組織中l(wèi)ncRNACCAT1較癌旁組織明顯低表達(dá)(P=0.000),見圖1。圖2.肝癌中l(wèi)ncRNACCAT1的表達(dá)量與臨床病理因素的關(guān)系:lncRNACCAT1的表達(dá)量與門靜脈癌栓(χ2=15.229,P<0.05)及TNM分期(χ2=4.196,P=0.041)具有相關(guān)性,而與患者年齡、性別、腫瘤直徑、酗酒等無明顯相關(guān)(P>0.05,表1)。
3.lncRNACCAT1與肝癌患者預(yù)后的關(guān)系:
對96例肝癌患者進(jìn)行生存分析。Kaplan-Meier分析顯示:HLA-F陽性患者術(shù)后平均生存時間為32.1個月(95%CI:26.3~38.0個月);HLA-F陰性患者術(shù)后平均生存時間為47.2個月(95%CI:42.5~52.0個月)。HLA-F陽性患者生存時間短于陰性患者,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=7.607,P=0.006,圖2)。COX回歸模型分析肝癌患者預(yù)后影響因素,單因素分析顯示:HLA-F表達(dá)、TNM分期均是肝癌患者術(shù)后生存時間的危險因素。多因素分析顯示HLA-F更是影響肝癌患者術(shù)后生存的獨立危險因素(表2)。
討論
長鏈非編碼RNA(longnoncodingRNA,lncRNA)是一群長度>200bp的RNA,不具有編碼功能,以往認(rèn)為其是RNA聚合酶Ⅱ的轉(zhuǎn)錄副產(chǎn)物,不具備生物學(xué)功能[6]。但是近些年來研究表明,lncRNA可以在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后等不同水平參與下游基因的調(diào)控,與腫瘤發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)[6~8]。其可能的作用機(jī)制:①按照堿基配對原則,參與mRNA前體修飾;②與蛋白質(zhì)或miRNA結(jié)合,調(diào)控相關(guān)基因的表達(dá);③招募染色質(zhì)修飾酶復(fù)合物致目標(biāo)基因區(qū)域,參與其表觀遺傳學(xué)修飾[9~11]。lncRNACCAT1是一個擁有2628bp的非編碼RNA分子,最早在結(jié)腸癌中被發(fā)現(xiàn),位于8q24.21、轉(zhuǎn)錄因子C-Myc附近,研究表明這是基因突變的高發(fā)區(qū)[12]。近年來已有研究顯示CCAT1在膽管癌等腫瘤組織中高表達(dá)[13~15],參與腫瘤惡性進(jìn)展。Jiang等[13]研究發(fā)現(xiàn)CCAT1在膽管癌組織中的表達(dá)較癌旁組織高,其表達(dá)量與組織分化程度、淋巴結(jié)侵襲、TNM分期及患者預(yù)后相關(guān),是膽管癌患者的獨立預(yù)后因素。Zhang等[14]研究顯示CCAT1可通過負(fù)調(diào)控miR-218-5P促進(jìn)視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤SO-RB50及Y79細(xì)胞株的增殖、侵襲、遷徙、并減少凋亡,可作為視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的潛在治療靶點。研究發(fā)現(xiàn),結(jié)腸癌患者中l(wèi)ncRNACCAT1和HOTAIR表達(dá)升高,有望成為結(jié)腸癌篩查指標(biāo),提高結(jié)腸癌陽性診斷率。筆者采用RT-PCR法分析了lncRNACCAT1肝癌組織中的表達(dá)情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn):①lncRNACCAT1在肝癌癌灶組織中表達(dá)升高;②其表達(dá)量與患者年齡、腫瘤直徑、漿膜侵犯、TNM分期等無明顯相關(guān),而與門靜脈癌栓和腫瘤數(shù)目表現(xiàn)出一定相關(guān)性;結(jié)合上述兩點,筆者推測lncRNACCAT1高表達(dá)可能在肝癌惡性進(jìn)展中發(fā)揮重要作用;③生存分析發(fā)現(xiàn)lncRNACCAT1表達(dá)陽性患者預(yù)后較差,可作為肝癌患者預(yù)后的獨立危險因素。總之,筆者研究了lncRNACCAT1在肝癌組織中的表達(dá)特點和預(yù)后意義,推測lncRNACCAT1表達(dá)在肝癌發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要作用;并且lncRNACCAT1表達(dá)與預(yù)后相關(guān),是肝癌患者的獨立預(yù)后影響因素,對判斷肝癌患者預(yù)后具有重要參考價值。但lncRNACCAT1在人體生理病理中其臨床意義及作用機(jī)制等研究剛剛起步,仍需要進(jìn)一步探索。
作者:陳思思陳霞蔣瓊英徐永富朱昱胡鵬單位:溫州醫(yī)科大學(xué)附屬浙江省臺州醫(yī)院口眼中心