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DNA標(biāo)識(shí)對(duì)法醫(yī)鑒定的影響范文

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DNA標(biāo)識(shí)對(duì)法醫(yī)鑒定的影響

作者:陳吉娜單位:福建正德信司法鑒定所

以單核苷酸多態(tài)性(SNP)為核心的dna分子標(biāo)記:SNP是基因組中單個(gè)堿基缺失和插入,單個(gè)核苷酸的顛換產(chǎn)生的差異。SNP位點(diǎn)幾乎遍布于整個(gè)基因組;其遺傳穩(wěn)定性高,易于進(jìn)行自動(dòng)化分析。

SNP在種群中是二等位基因性的,部分SNP可能會(huì)直接影響蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)或基因表達(dá)水平。對(duì)于SNP的檢測(cè)可以通過(guò)經(jīng)典的凝膠電泳法以及高通量的檢測(cè)方法如,DNA測(cè)序法、DNA芯片檢測(cè)、飛行質(zhì)譜儀檢測(cè)、變性高效液相色譜法等。Westen等和Mead等的實(shí)驗(yàn)結(jié)果均表明,對(duì)于腐敗降解的檢材,SNP的DNA分析結(jié)果較STR的分析結(jié)果好。

用于法醫(yī)學(xué)的DNA分子標(biāo)記技術(shù)

1常染色體分析:隨著復(fù)合熒光標(biāo)記技術(shù)以及自動(dòng)分型儀器的使用,使得工作者能從少量的DNA檢材中獲得遺傳信息,STR-PCR分析已經(jīng)成為法醫(yī)DNA檢驗(yàn)中的主要技術(shù)手段。人體基因組中含有高變區(qū),這些高變區(qū)是一些串聯(lián)重復(fù)序列。STR廣泛存在于真核生物基因組中,其核心序列為2~6bp,重復(fù)次數(shù)通常在5~40之間。STR具有多態(tài)性高,操作簡(jiǎn)單、檢測(cè)靈敏度高等優(yōu)點(diǎn)。自20世紀(jì)末STRs商業(yè)試劑盒投入生產(chǎn)并廣泛使用以來(lái),大批商業(yè)試劑盒,都包含有15~16個(gè)高多樣性的STR基因座,例如PowerPlex○RESX、ESI系統(tǒng)、AmpFlSTR○RNGM,這些試劑盒在引物設(shè)計(jì),緩沖液成分、擴(kuò)增條件,提高痕量樣本的分析等方面進(jìn)行了改進(jìn)。同時(shí)商業(yè)試劑也在處理降解DNA和痕量DNA方面進(jìn)行改進(jìn),例如減少旁側(cè)區(qū)的擴(kuò)增長(zhǎng)度,增加核心位點(diǎn),如miniSTR,以適合更多痕量檢材的檢測(cè)。

2性染色體分析:對(duì)于常染色分析受限的檢材,性染色體STR為法醫(yī)個(gè)體識(shí)別和親權(quán)鑒定提供了新途徑。Y染色體由父親直接遺傳給兒子,大部分Y染色體不發(fā)生重組,后代遺傳變異小,在男性組織成分的個(gè)體識(shí)別和父系家族的親權(quán)鑒定中具有獨(dú)特的應(yīng)用價(jià)值。Thomas等利用電離飛行時(shí)間質(zhì)譜分析了來(lái)自不同種族的16個(gè)Y-STR基因座,結(jié)果可行。由于Y-STR的局限性,在應(yīng)用Y-STR進(jìn)行家系調(diào)查時(shí)應(yīng)注意應(yīng)用的范圍,排查前要收集族譜,明確家庭間的遺傳關(guān)系。X-STR對(duì)于雙親缺乏的同父異母姐妹親緣關(guān)系認(rèn)定、涉及父女關(guān)系的單親親權(quán)鑒定等方面案件有特殊作用。X染色體在遺傳過(guò)程中為性連鎖遺傳,在X-STR的應(yīng)用中應(yīng)注意連鎖不平衡和單倍體等問(wèn)題。單個(gè)STR基因座能提供的信息量有限,主要依靠X-STR復(fù)合擴(kuò)增體系。暢晶晶等通過(guò)中國(guó)華東地區(qū)漢族人群200個(gè)無(wú)關(guān)個(gè)體的調(diào)查建立遺傳學(xué)資料,篩選出了48個(gè)位點(diǎn)分型結(jié)果穩(wěn)定、重復(fù)性好的X-SNP位點(diǎn)。

3線粒體DNA分析:人類線粒體DNA(mtDNA)是分布于細(xì)胞核外的人類遺傳物質(zhì),存在于各種組織、細(xì)胞中,呈穩(wěn)定的母系遺傳,mtDNA序列多態(tài)性大多局限于D-Loop區(qū)。除血、組織等常見(jiàn)檢材外,毛發(fā)、指甲等特殊檢材也可以用于mtDNA分析。目前主要采用熒光標(biāo)記的循環(huán)測(cè)序法進(jìn)行mtDNA測(cè)序,但檢測(cè)成本較高,應(yīng)用受到一定限制。國(guó)外已建立有專門的mtDNA數(shù)據(jù)庫(kù)EMPOP(EuropeanmtDNAPopulationDatabase)。張明陽(yáng)等采用限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性PCR(PCR-RFLP)法,用限制酶RsaI和MnlI消化線粒體DNA控制區(qū)(mtDNAD-LOOP區(qū)),檢測(cè)mtDNA,認(rèn)為PCR-RFLP法適合在基層實(shí)驗(yàn)室中用于mtDNA分析。

4全基因組擴(kuò)增(WGA):以PCR技術(shù)為基礎(chǔ)的熒光標(biāo)記STR分型技術(shù)在觸及模板DNA的量極少時(shí),PCR擴(kuò)增就會(huì)發(fā)生隨機(jī)效應(yīng),雜合子會(huì)現(xiàn)不對(duì)稱擴(kuò)增,甚至出現(xiàn)等位基因丟失的檢驗(yàn)結(jié)果。對(duì)于一些高度降解、痕量的DNA檢材,常常因?yàn)镈NA模板不足而無(wú)法成功檢測(cè)。WGA技術(shù)是對(duì)整個(gè)基因組序列進(jìn)行非選擇性的擴(kuò)增,該技術(shù)可以對(duì)痕量的組織、甚至單個(gè)細(xì)胞的進(jìn)行全基因組擴(kuò)增。WGA主要分為兩類:一類是基于PCR的WGA技術(shù),主要有簡(jiǎn)并寡核苷酸引物PCR(DOP-PCR)、連接反應(yīng)介導(dǎo)PCR(LM-PCR)、擴(kuò)增前引物延伸反應(yīng)(PEP);但這些方法都不適用于痕量模板的擴(kuò)增。另一類是基于等溫反應(yīng)的WGA技術(shù),如:多重置換擴(kuò)增(MDA)和基于引物酶的全基因組擴(kuò)增技術(shù)(pWGA)。全自動(dòng)化工作站和DNA自動(dòng)序列分析技術(shù)的開(kāi)發(fā)和應(yīng)用,實(shí)現(xiàn)了生物檢材進(jìn)行批量處理分析。隨著分子生物學(xué)理論與技術(shù)的不斷發(fā)展和完善,通過(guò)生物信息學(xué)、基因芯片等高新分子標(biāo)記技術(shù)的相互融合、滲透以及DNA數(shù)據(jù)庫(kù)的建立,必將不斷開(kāi)發(fā)出更多信息量大、準(zhǔn)確度高、成本低的適用于法醫(yī)工作的分子標(biāo)記技術(shù)。

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