禽源冠狀病毒感染情況調(diào)查范文

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冠狀病毒（Coronavirus）最早于1937年從雞的感染組織中被發(fā)現(xiàn)，因病毒表面有王冠般的釘狀突起，被國(guó)際病毒命名和分類委員會(huì)命名為冠狀病毒。冠狀病毒屬于冠狀病毒科（familyCoronaviridae）、套式病毒目（orderNidovirales）。根據(jù)病毒形態(tài)、基因組結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)情況，2012年國(guó)際病毒分類委員會(huì)（ICTV）將冠狀病毒分為冠狀病毒亞科（Coronavirinae）和環(huán)曲病毒亞科（Torovirinae）。冠狀病毒亞科的病毒，即人們常說(shuō)的冠狀病毒，分為甲型冠狀病毒屬（Alphacoronavirus）、乙型冠狀病毒屬（Betacoronavirus）、丙型冠狀病毒屬（Gammacoronavirus）和丁型冠狀病毒屬（Deltacoronavirus）四個(gè)屬[1-2]。來(lái)源于禽鳥的冠狀病毒統(tǒng)稱為禽源冠狀病毒（avian-origincoronavirus），至少涉及到丙型和丁型2個(gè)冠狀病毒屬。目前，僅在野禽中發(fā)現(xiàn)少數(shù)丁型冠狀病毒屬病毒，包括白頭翁冠狀病毒（Bulbulcoronavirus）、畫眉冠狀病毒（Thrushcoronavirus）和文鳥冠狀病毒（Muniacoronavirus）[3]。丙型冠狀病毒屬目前包括兩個(gè)被ICTV認(rèn)可的“種”，即禽冠狀病毒（Aviancoronavirus）和白鯨冠狀病毒（Belugawhalecoronavirus），其中禽冠狀病毒包括雞傳染性支氣管炎病毒（IBV）和火雞冠狀病毒（TCoV）[1]。鴨冠狀病毒、鵝冠狀病毒和鴿冠狀病毒也可能是丙型冠狀病毒屬中與禽冠狀病毒不同的“種”，但由于目前僅了解這些病毒全基因組中的一小部分序列，其分類地位還沒有得到ICTV的正式確認(rèn)[1]。

1傳染性支氣管炎病毒

雞傳染性支氣管炎（IB）是由傳染性支氣管炎病毒引起的雞的一種急性、高度接觸性傳染病，以咳嗽、氣管啰音和打噴嚏為主要特征，是對(duì)我國(guó)養(yǎng)雞業(yè)危害最為嚴(yán)重的病毒性傳染病之一。該病幾乎在全球所有養(yǎng)雞國(guó)家中存在，并呈地方性流行[6]。雞傳染性支氣管炎于1930年首先在美國(guó)達(dá)科他州（Dakota）被發(fā)現(xiàn)。1936年，Beach和Schalm確定該病原為病毒，這是首個(gè)被發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒，后被命名為IBV，歸入冠狀病毒科丙型冠狀病毒屬[1]。本病的易感動(dòng)物主要是雞，各種日齡與品種的雞均易感。近年來(lái)，在鴨、鴿、鵝和鷓鴣等宿主中也分離到與IBV高度同源的冠狀病毒[5-8]。根據(jù)冠狀病毒對(duì)組織的親嗜性及損害的主要器官的不同，IBV在臨床上可分為以下幾個(gè)類型：呼吸和生殖道型，代表毒株：麻省毒株H52、H120；腎臟病變型，代表毒株：澳大利亞T株、Connecticut株、美國(guó)Holte和Gray以及一些M株；腸道病變型，代表毒株：摩洛哥G株；腺胃型；其他變異型，代表毒株4/91或793B。IBV血清型眾多，目前已報(bào)道有30余種，不同血清型毒株在毒力、致病性和組織嗜性上存在很大差異，相互間沒有或僅有部分交叉免疫性。近些年，由于新血清型的不斷出現(xiàn)，導(dǎo)致IB在我國(guó)的流行呈上升趨勢(shì)，尤其是腎病變型IB已蔓延至全國(guó)各養(yǎng)雞地區(qū)。2013年7月，劉沛增等在全國(guó)隨機(jī)抽取安徽、海南、貴州等9個(gè)省市共88個(gè)養(yǎng)禽場(chǎng)，進(jìn)行IBV的流行病學(xué)調(diào)查，結(jié)果發(fā)現(xiàn)9個(gè)省均有IBV分布，場(chǎng)群陽(yáng)性率為68.18%（60/88），其中養(yǎng)雞場(chǎng)的場(chǎng)群陽(yáng)性率為77.92%（60/77），說(shuō)明IBV在我國(guó)養(yǎng)雞場(chǎng)普遍存在[9]。2008年，在英國(guó)、法國(guó)、荷蘭、德國(guó)、比利時(shí)和西班牙所選定農(nóng)場(chǎng)的獸醫(yī)或農(nóng)場(chǎng)主提供的咽拭子樣品中，IBV陽(yáng)性率為59%，檢測(cè)到的優(yōu)勢(shì)流行毒株為793B和麻省毒株[10]。2014年，Eder等報(bào)道，巴西肉雞場(chǎng)的IBV場(chǎng)群陽(yáng)性率為24.8%，在種雞群的場(chǎng)群陽(yáng)性率為16.8%[11]。2014年，Emily等對(duì)2000—2013年間，從加拿大收集的185個(gè)場(chǎng)點(diǎn)的禽樣品（148個(gè)場(chǎng)點(diǎn)的樣品有臨床癥狀，37個(gè)場(chǎng)點(diǎn)為隨機(jī)選擇的肉雞屠宰場(chǎng)樣品）進(jìn)行IBV分型，結(jié)果分為四個(gè)較大的型：超過(guò)1/3的場(chǎng)點(diǎn)（35.7%）所流行的為加拿大型毒株，與Qu_mv毒株同源性為90.9%~99.2%；經(jīng)典毒株（麻省和Connecticut）的陽(yáng)性率約為1/3（28.6%）；美型毒株的場(chǎng)點(diǎn)流行率約為1/5（20.5%）；4/91型毒株的場(chǎng)點(diǎn)流行率為15.14%[12]。

2火雞冠狀病毒

在上世紀(jì)七十年代，火雞冠狀病毒（TCoV）是引起火雞腸道病的重要病原，由此引發(fā)的疾病被稱為傳染性腸胃炎、冠狀病毒性腸炎和藍(lán)冠病。1951年美國(guó)首次報(bào)道該病，其他國(guó)家隨后也有報(bào)道。2001年，美國(guó)首次證實(shí)該病的存在[15]，之后，巴西和意大利也證實(shí)發(fā)現(xiàn)此病。2006年，楊仉生等首次在我國(guó)分離到TCoV，引起25日齡火雞發(fā)病，死亡率為10%~20%[14]。在英國(guó)，通過(guò)RT-PCR方法對(duì)TCoV進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)，通過(guò)免疫熒光法和ELISA方法對(duì)火雞進(jìn)行血清抗體檢測(cè)，證實(shí)其發(fā)病率>30%[15]。TCoV可感染任何日齡的火雞，導(dǎo)致的死亡率與日齡相關(guān)，雛火雞的死亡率高，日齡大的死亡率較低，但會(huì)引起肉、蛋產(chǎn)量下降[16-19]。禽群感染火雞冠狀病毒后會(huì)引起腹瀉，影響其生長(zhǎng)速度和飼料轉(zhuǎn)化率，頭及頸部皮膚可能發(fā)紺，因此稱為藍(lán)冠病。7周齡火雞感染火雞冠狀病毒后可引發(fā)嚴(yán)重傳染病——幼火雞復(fù)合性腸炎（PEC），癥狀表現(xiàn)為腹瀉、脫水、生長(zhǎng)停滯、體重下降、免疫系統(tǒng)功能障礙。如果幼火雞同時(shí)表現(xiàn)臨床死亡，則稱為幼禽腸炎和死亡綜合征（PEMS）。類似于IBV，TCoV也會(huì)引起種禽產(chǎn)蛋量和蛋質(zhì)量的下降，出現(xiàn)軟殼蛋、糙殼蛋，蛋殼顏色變淺以及孵化率降低等。上世紀(jì)90年代中期，北卡羅萊納大學(xué)的研究人員證實(shí)，TCoV在抗原性和基因遺傳性上與IBV密切相關(guān)，基于免疫熒光法和酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)，證實(shí)這兩種病毒之間存在交叉反應(yīng)性。

3鴨冠狀病毒

鴨冠狀病毒性疾病是一種以劇烈腹瀉為特征的急性傳染病。20日齡前后的鴨發(fā)病率最高，甚至出現(xiàn)暴發(fā)流行。疫情開始會(huì)出現(xiàn)少數(shù)鴨發(fā)病，1~2天后出現(xiàn)死亡高峰，發(fā)病率和死亡率幾乎為100%。臨床上表現(xiàn)為：發(fā)病急；早期排稀糞，進(jìn)而腹瀉；糞呈白色或黃綠色；喙變紫，上皮脫落破潰。2012年，陳貴錢等通過(guò)高通量測(cè)序方法，在家鴨中發(fā)現(xiàn)了一種未知的禽源冠狀病毒，分析發(fā)現(xiàn)其基因1中三個(gè)部分氨基酸序列（1b1，1b2，1b3）與IBV的差異率在10%以上，顯示其可能屬于丙型冠狀病毒屬的一個(gè)新“種”，即鴨冠狀病毒[21]；2014年，莊青葉等通過(guò)大規(guī)模監(jiān)測(cè)，在家鴨中發(fā)現(xiàn)大量新“種”鴨冠狀病毒，鴨群感染率為4.38%[22]。在國(guó)外，有兩篇研究報(bào)道從野生水禽（如野鴨）中檢測(cè)到與陳貴錢等人發(fā)現(xiàn)的鴨冠狀病毒相似的一些病毒，病毒感染率較高，提示這種新發(fā)現(xiàn)的禽冠狀病毒可能在家鴨和野生水禽中分布較為廣泛[23-24]。

4其他禽種冠狀病毒

4.1鴿冠狀病毒2005年，錢華冬等人在鴿子中檢測(cè)到冠狀病毒，后經(jīng)相關(guān)試驗(yàn)證實(shí)為鴿源冠狀病毒PSH株，其屬于丙型冠狀病毒，與IBV親緣關(guān)系較近，但并非本文述及的“鴿冠狀病毒”[8]。2005年，Jonassen等從挪威首都奧斯陸（Oslo）的野鴿中檢測(cè)到一種新型鴿冠狀病毒，與IBV差異較大，泄殖腔拭子樣品陽(yáng)性率為4.4%，氣管拭子樣品陽(yáng)性率為2.2%[24]。

4.2鵝冠狀病毒2000年，溫立斌等報(bào)道從鵝體內(nèi)檢測(cè)到類冠狀病毒，從臨床癥狀和剖檢變化上看部分特征和腎型IB類似，但是該病毒是否是由IBV變異而來(lái)還有待后續(xù)研究[6]。2005年，Jonassen等從挪威的灰鵝中檢測(cè)到新型鵝冠狀病毒，與IBV差異較大。研究中發(fā)現(xiàn)，在2003年Smola所采集泄殖腔拭子樣品中，雛鵝冠狀病毒陽(yáng)性率為12.9%，成年鵝陽(yáng)性率為17.4%；在2004年Smola所采集泄殖腔拭子樣品中，雛鵝冠狀病毒陽(yáng)性率為66.6%，成年鵝陽(yáng)性率為15.4%；在2004年從Vega所采集泄殖腔拭子樣品中，雛鵝冠狀病毒陽(yáng)性率為42.3%，成年鵝陽(yáng)性率為38.9%[24]。

4.3野鳥冠狀病毒目前已報(bào)道發(fā)現(xiàn)少數(shù)來(lái)自野禽的冠狀病毒。2009年，Patrick等報(bào)道在香港發(fā)現(xiàn)白頭翁冠狀病毒（陽(yáng)性率為3.58%，15/420）、畫眉冠狀病毒（陽(yáng)性率為1.69%，4/237）和文鳥冠狀病毒（陽(yáng)性率為1.71%，2/117），與丙型冠狀病毒屬病毒基因特性不同，被歸入丁型冠狀病毒屬。

5結(jié)語(yǔ)

隨著分子生物學(xué)發(fā)展，冠狀病毒的檢測(cè)方法越來(lái)越多，基因分析方法越來(lái)越科學(xué)，人們對(duì)禽類冠狀病毒的分類有了新的認(rèn)識(shí)。本文中述及的各種冠狀病毒，均按病毒的分類學(xué)定義，而非按宿主簡(jiǎn)單歸類。在禽類所感染的冠狀病毒中，有些已被定義為新種，有些病毒新種尚未確定。明確這些病毒的分類地位、病原特性及感染狀況，將更有利于對(duì)禽類冠狀病毒感染相關(guān)疾病的防控和處置。

作者：莊青葉 陳繼明 王楷宬 單位：中國(guó)動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心